包含工作内容：档案借卷出库、档案拆卷、档案数字化前处理质检、档案扫描、图像处理、图像质检、档案装订（还原）、档案归还入库、档案数据移交等。
档案整理主要有3种类型
①系统排列和编目
在正常条件下，档案室接收文书部门和业务部门按照归档要求立好的案卷，档案馆接收各机关按照入馆要求整理移交的案卷。档案馆和档案室的整理任务，主要是检查案卷质量，制订馆(室)内分类排列方案，进行案卷和全宗的系统排列以及案卷目录的加工
②局部调整
对已接收但不完全符合整理要求的案卷，进行必要的部分加工整理；对由于遭受损失、销毁与移出等各种原因致使整理体系发生重大变化的档案,进行新的系统化调整
③全过程整理
对必须接收和征集的零散档案，进行包括整理工作全部内容的系统化和编目。
档案整理要求保持文件之间的历史联系，便于保管利用。文件之间的历史联系是指文件在产生和处理过程中形成的内部相互关系，主要表现在文件的来源、时间、内容和形式等方面的联系。维护文件之间的历史联系有时可采用不同的方法，在优选时应以便于档案保管和利用为其最高要求，并使二者统一起来。